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本帖最后由 zhousht 于 2020-7-4 20:09 编辑 ) H7 U/ M! m9 X4 S( a
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COVID-19的来源:卡尔加里大学的研究表明,SARS-CoV-2自2013年以来缓慢发展
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/ d4 e: F- \8 H9 b加拿大卡尔加里大学的科学家表示,至少从2013年以来,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)可能已在人类中传播,尽管与造成现在大流行的病毒变种不同。
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) }# V4 k' \+ o* I0 ?尽管科学家们一直在研究病毒基因组以寻找更多信息,但有人建议该病毒从一种动物跃入人类。尽管研究指出它的起源是自然的而不是人为的,但也有一些关于在实验室中制造它的理论。上个月,WHO通过了一项决议,调查该病毒的起源。& I3 P: [4 h; D/ o) n
0 @ i% `. ^, K1 l) X7 p* V2 @现在,加拿大卡尔加里大学的一组科学家说,造成COVID-19的病毒(SARS-CoV-2)至少从2013年开始就已经在人群中传播,尽管与引起这种情况的变种与当前的大流行变种不同。* `2 b9 W$ K6 s$ A
# C! J+ B* U* |3 k该研究的结果目前可在预印本服务器Biorxiv中使用,并且该研究尚未经过同行评审。
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本文还探讨了SARS-CoV-2的可能起源以及ACE-2受体在病毒的感染性(感染能力)中起着多大作用。2 z# K7 F, q* T$ h# o
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病毒进化的过程
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为了能够生存,病毒会随着其宿主生物不断发展。当病毒跳跃宿主时,通常会出现一种新的病毒病原体,例如从动物到人类。因此,即使该病毒在原始动物宿主中引起轻度疾病或没有引起疾病,它在人类中也可能是高度传染性/高毒性的。就冠状病毒而言,已经发现病毒生活在蝙蝠内部而不会对蝙蝠造成太大损害,因为蝙蝠的免疫系统已经进化,可以控制病毒。但是人类却并非如此。结果,人类感染病毒容易生病。, T0 x% e& V. ?0 v- R" Y/ M3 E
2 ~9 L0 U0 n- }8 E' z研究发现4 t" F) C) S7 D
! m' o) i" J( s7 T7 B- G该研究检查了SARS-CoV-2刺突蛋白的当前变体,以及它与人类ACE-2受体(hACE-2)结合的强度。新冠病毒的突突蛋白与人体细胞上的ACE-2受体之间的结合是帮助病毒进入健康细胞的原因。
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$ n( E# a! i& s7 G, A1 G在这项研究中,卡尔加里大学的研究人员调查了2019年12月30日至2020年3月20日之间收集的约479种新型冠状病毒基因组序列,以了解其系统发育-这意味着该病毒的进化发展 ,以及与其他关系密切病毒的关系。0 }% T) K: g" J4 s
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在所有基因组中,研究人员发现感染率超过5%的病毒约有16种变异和大约11种错义突变(其中一个核苷酸的变化使DNA / RNA编码不同的蛋白质),每种感染都有自己的系统发育树。
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W5 x: S; H7 b% P* |/ x/ h他们的另一项初步发现是与蝙蝠和穿山甲冠状病毒的相似性。已发现SARS-CoV-2的基因组与蝙蝠冠状病毒RaTG13至少有96%的相似性,与穿山甲冠状病毒(Pangolin-CoV)至少有90%的相似性。以前曾有人提出,当前的病毒是这两种病毒的组合,是由于宿主中的共同感染而产生的。
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为了研究起源,研究人员试图创建SARS-CoV-2突突蛋白受体结合域的遗传序列。受体结合结构域是刺突蛋白中实际上识别并与ACE-2受体结合的部分。他们为所有SARS-COV-2病毒创建了一个共同的遗传RBD序列,并将其标记为N1,并用最接近的动物病毒的变种标记为N0(N-零)。3 U. h! v% j3 F( ]5 H
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他们的发现:
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N1序列与SARS-CoV-2病毒的参考序列相同,正如所预期的那样,而N0序列是唯一的,指向病毒的独特来源。
- I2 v' \' y+ Q$ D% J两个RNA / DNA序列仅在四个位置不同。
( m# N0 |3 [5 }& H: N' Y; j祖先的序列产生了各种后代,而RaTG13是SARS-COV-2病毒的近亲之一。由于RaTG13是在2013年左右发现的,因此引起病毒的COVID-19的原始祖先一定也在那时。
y9 M i. L, V$ q有趣的是,该病毒的早期变体与hACE2的结合远比最近的变体强。
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结论:
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4 J# w9 x- B1 F3 @; J7 [研究表明,SARS-CoV-2的结合亲和力可能不是其传染性的决定因素。肯定还有其他变化导致病毒对人类的感染性增加。同样,该病毒的祖先可能已经感染了人类一段时间,但症状较少。# z% p5 | J% i9 P, a$ }6 W
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